在生物医学研究中，Tert-PEG-Tert 广泛应用于生物分子的修饰和保护。例如，它可以用于修饰蛋白质、肽段或核酸，通过乙酸叔丁酯保护生物分子中的羧基，防止不必要的反应。这种保护策略在多肽合成和蛋白质工程中尤为重要，能够确保生物分子在合成过程中的稳定性。此外，Tert-PEG-Tert 还可以用于构建药物递送系统，通过PEG链延长药物在体内的循环时间，减少免疫反应。

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