这种化合物广泛应用于生物医学研究和荧光成像。在生物医学领域，Cy3-PEG-Aminooxy可用于标记和修饰生物分子，如蛋白质、抗体等。例如，通过氨基氧基与生物分子上的醛基或酮基反应，可以将Cy3荧光团引入生物分子，实现生物分子的荧光标记和检测。在细胞生物学中，Cy3-PEG-Aminooxy可用于荧光成像，实时监测生物分子的动态变化。例如，通过荧光显微镜观察，可以研究生物分子在细胞内的分布和代谢过程。

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