在生物医学领域，Cy5.5-PEG-amine 主要用于生物分子的荧光标记和成像。通过氨基与生物分子中的羧基发生酰胺化反应，可以将 Cy5.5 荧光染料共价连接到生物分子上。这种标记方法具有反应条件温和、快速且特异性高的优点，适用于标记蛋白质、肽段、抗体等生物分子。例如，在细胞生物学研究中，Cy5.5-PEG-amine 可用于标记细胞表面的受体蛋白或细胞内的信号分子，通过荧光显微镜观察其在细胞内的定位和动态变化。

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