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CY3-NFKBdecoy,CY3标记NF-κB诱饵的化学特性

时间:2025-07-29 10:19:31       浏览:23
CY3-NFKBdecoy,CY3标记NF-κB诱饵的化学特性
CY3-NF-κB诱饵(CY3-NFκB decoy)是一种将荧光染料CY3共价标记在NF-κB诱饵寡核苷酸(NFκB decoy ODN)上的荧光探针,用于研究转录因子NF-κB的核转运、结合行为及其在信号通路中的调控机制。该分子兼具高特异性核酸识别能力和可视化功能,应用于细胞内成像、机制研究以及靶向调控系统的构建中。其核心结构由两部分组成:一是具有特异性序列的双链寡核苷酸,模拟NF-κB结合位点;二是通过化学键连接的CY3荧光团,赋予其可追踪性。
NF-κB诱饵是通过人工合成的一段双链DNA,通常包含GGGACTTTCC序列或其衍生序列,能够与NF-κB转录因子中的p65/p50亚基结合,从而阻断其与内源性DNA启动子的结合。该诱饵ODN具有磷酸二酯骨架或经过修饰的磷硫酰骨架,以提高其体内稳定性和抗核酸酶降解能力。在合成CY3-NFκB decoy过程中,通常在5′端或3′端引入氨基修饰的核苷酸(如Amino-Modifier C6 dT),以便通过与CY3-NHS酯发生酰胺化反应实现荧光标记。
CY3为一种三甲基花青类染料,具有典型的共轭多环结构,吸收波长约为550 nm,发射波长约为570 nm,发出明亮的红橙色荧光。其NHS酯形式能够与ODN末端的伯胺高效偶联,反应条件温和(pH 8.5左右),偶联效率高,产物可通过HPLC或PAGE进行纯化。标记后的寡核苷酸保留其原有结构的双螺旋稳定性,并不干扰其与蛋白的特异性识别。
在化学性质上,CY3-NFκB decoy 具备较强的水溶性、电荷分布均匀以及良好的光稳定性。其荧光团位于分子末端,不影响诱饵序列的功能结构域,可在不改变生物活性的前提下用于共聚焦成像、荧光共定位分析以及分子轨迹追踪。此外,CY3标记还可用于与其他荧光探针(如FRET系统)联用,实现NF-κB活性的动态监测。
综上所述,CY3-NFκB decoy 作为一种结构稳定、反应可控、信号可检测的功能性分子工具,集靶向干预与荧光成像于一体,
产品名称:CY3-NFKBdecoy
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研

状态:固体/粉末/溶液


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