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CY7-phosphoramidite,CY7标记磷酸酰胺的化学结构

时间:2025-09-03 11:26:02       浏览:94

CY7-phosphoramidite,CY7标记磷酸酰胺的化学结构

CY7-Phosphoramidite是一种将近红外荧光染料Cyanine7与磷酸酰胺功能基团结合形成的标记物。磷酸酰胺(Phosphoramidite)用于DNA/RNA合成和寡核苷酸修饰中,可通过固相合成方法将CY7荧光基团引入寡核苷酸末端,实现可视化追踪和定量分析。了解CY7-Phosphoramidite的溶解度特性对于其制备、储存和应用至关重要。

化学结构与极性
CY7-Phosphoramidite由亲水的磷酸酰胺基团与疏水性的Cyanine7染料通过柔性链连接形成。染料部分疏水,而磷酸酰胺基团在极性有机溶剂中表现亲溶性,因此分子整体呈两性特征。该结构影响其在不同溶剂体系中的溶解性。
溶解性特点
有机溶剂:CY7-Phosphoramidite在无水极性有机溶剂中溶解性良好,例如二氢呋喃(THF)、乙腈(ACN)、二甲基亚砜(DMSO)和甲醇。这些溶剂可溶解高浓度CY7-Phosphoramidite,适用于固相核酸合成或反应前处理。
水相溶解性:由于染料疏水部分,CY7-Phosphoramidite在纯水中溶解性有限,易形成微粒或胶束。通常需要通过添加少量有机溶剂或辅以表面活性剂改善水相分散性。
缓冲体系:在极性缓冲液中,尤其是含一定比例有机溶剂(如10–20% ACN)的缓冲液,溶解度可得到改善,同时兼顾化学反应条件。
浓度与稳定性
高浓度溶液(>10 mM)可能出现聚集或荧光淬灭,尤其在长时间存储或光照条件下。低温避光储存可保持溶解性和荧光强度。溶液准备应在干燥、低光条件下进行,以避免水解或光漂白。
应用提示
在寡核苷酸合成过程中,CY7-Phosphoramidite通常先溶解于干燥ACN或THF中,并快速加入固相合成柱。溶液制备需保证均匀且无析出物,以确保偶联效率和标记均一性。偶联完成后,产物可通过纯化去除未反应物,得到高纯度CY7标记寡核苷酸。
产品名称:CY7-phosphoramidite,CY7标记磷酸酰胺
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研

状态:固体/粉末/溶液


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