Cyanine3 phosphoramidite 是一种基于 Cyanine3（Cy3）荧光染料 的核酸修饰试剂，广泛应用于 DNA、RNA 或寡核苷酸的荧光标记。Cy3 属于可见光区的荧光染料，具有明亮的橙红色发射光，其磷酰胺基团（phosphoramidite）使其能够在寡核苷酸固相合成过程中精确地引入荧光标签。通过这种方式，Cy3 可以与寡核苷酸的 5-末端或特定位点共价连接，从而在分子探针设计、荧光成像和生物分析中发挥关键作用。

结构与化学特性
Cyanine3 phosphoramidite 分子主要由以下部分组成：

Cyanine3 核心荧光单元：提供强荧光信号和高光稳定性。

柔性间隔链：通常是碳链或聚醚链，使染料与寡核苷酸间保持一定的空间距离，减少结构干扰。

磷酰胺基团：在固相合成过程中与寡核苷酸 5羟基发生化学反应，实现可控共价连接。

该化合物在干燥条件下化学稳定，疏水性较强，需要在有机溶剂（如 DMSO、DMF 或乙腈）中溶解。磷酰胺基团对水敏感，因此操作时需避免湿气，确保标记效率。

光学特性
Cyanine3 的激发波长约为 550 nm，发射波长约为 570 nm，呈明亮橙红色荧光。其量子产率高，信号强度高且光漂白速度较慢，非常适合常规荧光检测、荧光显微成像及流式分析。Cy3 发射峰窄且背景低，在多重荧光标记实验中可与 FAM、Cy5 等染料组合使用，实现多通道检测。

应用领域

核酸探针标记：用于 PCR、实时定量、荧光原位杂交（FISH）及微阵列芯片分析。

分子相互作用分析：作为 FRET 供体或淬灭对，研究核酸–蛋白质或核酸–核酸相互作用。

荧光成像：可在细胞或组织实验中提供稳定的荧光信号，适合多轮成像实验。

高通量生物分析：在分子识别、药物筛选和芯片实验中，Cy3 标记寡核苷酸提供敏感信号。

产品名称：Cyanine3 phosphoramidite
用途：科研
状态：固体/粉末/溶液
保存：冷藏
供应：西安瑞禧生物科技有限公司
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