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CY3-5-氟脱氧尿嘧啶-5′-单磷酸酯(Cy3-5-FdUMP)是一种荧光标记核苷酸衍生物,由5-氟脱氧尿嘧啶-5′-单磷酸酯(5-FdUMP)与远红橙荧光染料CY3共价结合形成。5-FdUMP是脱氧尿嘧啶的氟化衍生物,其分子在核苷酸位置保留了5′-磷酸基和糖环结构,可模拟天然核苷酸与核酸或酶结合。CY3是一种远红橙荧光染料,具有较强的荧光信号和较窄的发射波长,可通过激发光在550–570 nm范围内发射光,便于在体外体系中进行分子追踪和核酸结合行为分析。
通过CY3标记,FdUMP不仅保留了水溶性和核苷酸骨架结构,还具备可视化能力,可用于体外分子动力学研究、酶结合实验以及载体输送体系追踪分析。荧光标记分子与天然核苷酸的相似性,有利于研究分子在生物体系中的行为,同时提供非破坏性检测手段。
2. 化学结构特点
(1)核苷酸核心结构
Cy3-5-FdUMP保留了脱氧核糖和磷酸骨架的基本结构。脱氧核糖环上的5′-羟基通过磷酸酯化形成单磷酸酯,而糖环的3′-羟基保持自由,允许其参与进一步化学或酶学反应。糖环与氮碱基通过β-N-糖苷键连接,形成稳定核苷结构,为与酶或核酸链结合提供基础构型。
(2)碱基修饰与氟原子
5-氟脱氧尿嘧啶的碱基在5位位置引入氟原子,该位置正是天然尿嘧啶的反应敏感位点。氟原子的存在可影响碱基的电子密度和氢键能力,同时不显著破坏核苷酸骨架的空间构型。该特点使FdUMP在模拟天然脱氧尿嘧啶行为的同时,保持可控的化学反应性和稳定性。
(3)荧光染料接枝
CY3染料通过其活性官能团(通常为NHS酯或异硫氰酸基)与FdUMP的可反应位点(如碱基氨基或糖环修饰位点)共价结合,形成稳定的共价键。染料接枝一般位于核苷酸外周,避免影响磷酸骨架或碱基氢键配对能力。CY3的共轭结构赋予分子远红橙荧光特性,吸收峰约为550 nm,发射峰约为570 nm,使分子在荧光显微镜或光谱分析中易于检测。
产品名称:Cy3-5-FdUMP,CY3-5-氟脱氧尿嘧啶-5′-单磷酸酯
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研
厂家:瑞禧生物

产品目录
ICG-sucrose 吲哚菁绿标记蔗糖
ICG-TPP 吲哚菁绿标记磷酸三苯酯
ICG-Transferrins 吲哚菁绿标记转铁蛋白
ICG-UrolithinA 吲哚菁绿标记尿石素A
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