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CY3-PU22 是在寡核苷酸 PU22 的基础上,通过共价方式引入橙红色荧光染料 Cy3 而形成的荧光核酸探针。PU22 通常指富含鸟嘌呤(G-rich)的 22-mer DNA 序列,能够在特定条件下形成四链体(G-quadruplex)结构。这类序列在结构生物学、核酸折叠研究、分子识别、核酸材料设计以及序列构象动力学分析中具有重要作用。由于 PU22 在溶液中能够呈现多样的构象状态,标记荧光染料有助于监测其结构变化、与配体或蛋白质的结合行为以及形成特定构象时的光学响应特征。
在 PU22 上引入 Cy3 后,形成的 CY3-PU22 不仅保持原有的核酸序列功能,同时获得直接可读的光学信号,使研究者能够利用荧光成像、光谱分析或多通道检测方式观察和分析 PU22 的空间行为。Cy3 的吸收和发射均处于可见光区域,信号输出稳定,且能够在多色体系中与其他荧光标签配合使用,因此 CY3-PU22 在核酸可视化和动态追踪方面具有较好的适配性。
成分
CY3-PU22 的主要组成部分包括核酸主体 PU22 和荧光染料 Cy3:
PU22 核酸序列主体
PU22 是长度为 22 个核苷酸的寡核苷酸,富含鸟嘌呤残基,能够参与 Hoogsteen 氢键作用,从而形成 G4 结构。其核苷酸序列提供了基本的折叠潜力、构象可塑性以及多样的分子识别特性。作为寡核苷酸,PU22 在溶液中可受到金属离子浓度、pH 值和温度等因素影响,从而形成不同类型的四链体构象,如平行型、混合型或反平行型结构。Cy3 荧光染料
Cy3 属于多甲烯类染料,具有共轭结构和扩展 π 系统,使其能够在可见光区产生强烈荧光。Cy3 通常带有用于与核酸反应的功能基团,通过柔性连接方式连接到 PU22 的末端或非关键位点。该连接方式旨在避免对 PU22 的折叠或关键识别位点产生过强干扰,从而保持其结构特性。连接结构
Cy3 与 PU22 之间一般通过稳定的共价键连接,常见方式包括氨基修饰位点与活性 Cy3 基团之间的反应形成。连接臂在结构上具有一定柔性,可减少对核酸构象的限制,使荧光团在空间上相对自由地运动,以便在成像或光谱分析中获得更可靠的信号表现。
性质
CY3-PU22 兼具荧光探针和四链体形成序列的双重性质:
光学性质
Cy3 部分提供橙红色荧光,可通过常规激发光源进行检测。其光谱位置适合用于多通道成像,可与绿色和近红色荧光标签共同使用。信号稳定性较好,适合进行时间序列分析、折叠动力学研究或结构响应监测。结构可变性
PU22 序列在不同条件下能够形成多种四链体构象。CY3-PU22 在保持这一特性的同时,还能在构象变化时呈现可监测的光学响应,如荧光强度、偏振度或局部环境相关的光谱变化。可视化追踪能力
CY3-PU22 可用于观察核酸折叠过程、结构变化点、结合事件以及在复杂体系中的位置分布。例如,可用于研究 PU22 与蛋白质、小分子或金属离子的相互作用过程。体系兼容性
由于 PU22 为核酸分子,具有较好的水溶性,而 Cy3 的加入并不会显著降低其溶解性,因此 CY3-PU22 能够在多数水相环境中保持相对稳定的分散状态。
产品名称:CY3-PU22,CY3标记的PU22
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研
厂家:瑞禧生物

产品目录
CY5标记肼 Cy5-hydrazide
CY5标记菊粉 CY5-inulin
Cy5标记聚甘谷糖醛酸 Cy5-聚甘谷糖醛酸
Cy5标记聚酰胺-聚酰胺-胺型树枝状聚合物 CY5,10%,-PAMAM
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