Cy3-si435（Cy3 标记的 siRNA 435）是指将橙红色荧光染料 Cy3 共价连接到特定靶序列的 siRNA 分子（编号 435）上形成的荧光标记小干扰 RNA 探针。siRNA 435 通常为 21-23 个核苷酸的双链 RNA，能够通过 RNA 干扰机制与靶基因序列互补结合，从而调控目标 mRNA 的表达水平。Cy3 的引入使 siRNA 分子具备可视化特性，可用于跟踪其在体外体系或细胞内的分布、进入途径以及与细胞组分的相互作用。Cy3 本身具有延展共轭结构，吸收和发射波长处于可见光橙红色区域，信号清晰且易于通过常规显微成像、流式分析或多通道荧光检测系统观察。Cy3 标记通常位于 siRNA 的末端或非功能区，以尽量减少对其双链结构、RNA 干扰活性和与 RNA 诱导沉默复合物（RISC）的结合能力的影响。

Cy3-si435 的主要组成包括两条互补的 RNA 链和连接在其中一条链末端的 Cy3 荧光团。RNA 链由核糖核苷酸组成，具有一定的二级结构稳定性，可形成典型的双链 RNA 架构，为 RNA 干扰过程提供结构基础。Cy3 荧光团通过化学连接臂与 RNA 链末端形成共价键，连接臂通常设计为柔性结构，以减少对 RNA 架构的干扰，同时保证荧光团在成像过程中具有空间自由度，从而获得稳定且可靠的光学信号。该结构既保留了 siRNA 的功能特性，又为观察其行为提供了可读的荧光标记。

制备方法上，Cy3-si435 的形成通常包括 RNA 合成与荧光标记两步。首先通过固相合成获得 siRNA 的两条链，其中一条链带有可供标记的修饰基团（如氨基、硫醇或羧基）。然后在温和条件下通过与 Cy3 衍生物的化学反应（如胺-活性酯反应或硫醇-马来酰亚胺反应）将 Cy3 共价连接到 RNA 链的末端。反应条件通常控制在保证 RNA 二级结构稳定的温度和缓冲环境下，以避免链降解或非特异性交联。标记完成后，通过高效液相色谱（HPLC）或凝胶纯化等方法分离并回收纯度较高的 Cy3-si435 产物。最终产物为双链 RNA，含有端部 Cy3 荧光标记，既能够保持 RNA 干扰功能，又可在光学检测中提供稳定信号。

Cy3-si435 的特点在于光学可追踪性与 RNA 功能的结合。其功能包括可在细胞水平跟踪 siRNA 的摄取与定位、用于研究 RNA 干扰动力学、分析 RNA 与蛋白质复合物的形成，以及在多通道成像实验中与其他荧光探针配合使用。通过 Cy3 标记，siRNA 的空间分布、运输路径和降解过程能够被直观观察，为 RNA 干扰研究、基因调控实验和核酸递送体系提供重要信息。由于化学标记位置和反应条件可控，Cy3-si435 可在保持原有生物活性的同时实现高效示踪。

厂家：瑞禧生物

产品目录

Cy5标记凝血因子Ⅷ Cy5-凝血因子Ⅷ
CY5标记葡萄糖氧化酶 CY5-Glucose oxidase
Cy5标记齐多夫定 Cy5-Zidovudine
CY5标记琼脂 CY5-Agarose
Cy5标记曲克芦丁 Cy5-Troxerutin