CY3-siRISC（Cy3 标记的 siRNA，用于 RISC）是将橙红色荧光染料 Cy3 引入特定 siRNA 分子后形成的荧光标记产物，该 siRNA 可被 RNA 干扰复合物（RISC, RNA-induced silencing complex）识别并介导基因沉默。该标记分子由两条互补的核糖核苷酸链组成，其中一条链末端通过化学连接臂与 Cy3 荧光团共价结合，使 siRNA 在保持与 RISC 结合能力和干扰活性的同时，具备光学示踪功能。Cy3 荧光团的吸收和发射波长位于可见光橙红区域，信号易于通过荧光显微镜、流式分析仪或多通道成像系统检测，便于观察 siRNA 在体外体系或细胞内的分布、进入路径和动态行为。标记位置通常选择在非功能性末端或不干扰 RISC 结合区域，以保证 siRNA 的双链结构完整性和基因沉默能力。

CY3-siRISC 的组成主要包括双链 siRNA 主体和端部 Cy3 荧光团。siRNA 链由 21–23 个核糖核苷酸单元构成，形成典型的双链 RNA 架构，为 RISC 装载提供结构基础。Cy3 荧光团通过柔性连接臂与 RNA 链末端形成共价键，使标记分子在成像和检测中具有稳定信号输出，同时对 RNA 二级结构影响较小。该结构保证 siRNA 在结合 RISC 时仍保持原有的功能，同时赋予可视化示踪能力。

CY3-siRISC 的合成步骤通常包括三个主要阶段：RNA 链合成、Cy3 标记以及双链形成。首先，通过固相核酸合成技术制备两条互补的 RNA 链，其中一条链的末端带有可用于荧光标记的官能团（如氨基或羟基）。其次，在温和缓冲条件下，将 Cy3 衍生物与 RNA 链末端的修饰基团发生特异性共价反应，通过柔性连接臂固定 Cy3 分子。该步骤需要控制温度和 pH，以确保 RNA 不发生降解或非特异性交联。标记完成后，通常通过高效液相色谱（HPLC）或凝胶纯化方法分离并回收高纯度的 Cy3-siRNA 单链。最后，将两条互补链在适当条件下退火，形成功能性的双链 siRNA，即 Cy3-siRISC，可被 RISC 装载并发挥基因沉默作用。

CY3-siRISC 的特点包括：兼具 RNA 干扰功能和光学示踪能力，能够在细胞内观察 siRNA 的运输、分布以及与 RISC 的装载过程；荧光信号稳定，可在多次成像或时间序列观察中提供一致的读出；端部 Cy3 标记通过柔性连接设计，对 siRNA 构象和功能干扰最小，保证其与 RISC 的结合效率。功能上，Cy3-siRISC 可用于研究 RNA 干扰机制、RISC 装载动态、siRNA 在胞内的定位与降解，以及与其他荧光探针组合进行多通道成像。通过该化学设计，Cy3-siRISC 提供了兼顾基因沉默功能和可视化追踪的有效工具，为 RNA 干扰研究、核酸递送分析及分子机制探索提供了可靠手段。

厂家：瑞禧生物

产品目录

CY5标记山梨糖 CY5-Sorbose
cy5标记芍药苷 CY5-芍药苷
CY5标记十九氟癸酸 CY5-Perfluorodecanoic Acid
Cy5标记视黄醇结合蛋白 Cy5-视黄醇结合蛋白
Cy5标记丝裂霉素C Cy5-丝裂霉素C