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CY3-SODN19,CY3标记的SODN19的反应条件

时间:2025-12-08 09:58:48       浏览:98
CY3-SODN19,CY3标记的SODN19的反应条件

CY3-SODN19(Cy3 标记的 SODN19)是将橙红色荧光染料 Cy3 共价连接到 SODN19 核酸寡链上的荧光标记探针。SODN19 通常指长度为 19 个核苷酸的单链寡核苷酸,其序列可设计为与特定靶核酸互补,从而参与分子杂交、序列识别及结构研究。通过在 SODN19 分子上引入 Cy3,形成的 CY3-SODN19 可在保持核酸识别功能的前提下获得可视化能力,便于在体外体系或细胞实验中跟踪核酸分子的位置、分布及杂交行为。Cy3 荧光团吸收和发射位于可见光橙红区,信号强且稳定,可通过显微成像、荧光光谱或流式分析等方法直接检测。标记位置一般选择在核酸链的末端或非功能区,以减少对二级结构或杂交能力的干扰,同时保证荧光信号清晰可读。

CY3-SODN19 的主要组成包括 SODN19 核酸链和通过柔性连接臂与核酸末端形成共价键的 Cy3 荧光团。SODN19 核酸链由单链 DNA 或 RNA 组成,能够形成双链杂交或局部二级结构,为序列识别及功能研究提供基础。Cy3 荧光团的化学结构具有扩展共轭 π 系统,使其在可见光区产生稳定荧光,通过柔性连接臂与 SODN19 相连,不显著影响核酸链的折叠或结合行为。该结构保证 CY3-SODN19 在杂交实验或细胞示踪中既可发挥核酸功能,又能提供可观测的光学信号。

在反应条件方面,CY3-SODN19 的制备通常涉及在温和的缓冲体系中进行 Cy3 与 SODN19 修饰位点的共价反应。常用的化学连接方式包括胺-活性酯反应、硫醇-马来酰亚胺反应或其他可特异结合 Cy3 衍生物的官能团反应。反应通常在中性或弱碱性缓冲液中进行,温度保持在室温至 37°C 之间,以保证 RNA 或 DNA 链结构的完整性,同时避免标记过程中发生降解或非特异性交联。反应时间通常数小时至过夜,以确保高效结合。完成标记后,需通过高效液相色谱(HPLC)或凝胶纯化等方法分离未反应的 Cy3 衍生物和杂质,获得高纯度的 CY3-SODN19 产品。

反应体系通常使用低盐缓冲液以降低核酸链间非特异性结合,同时保持连接臂和 Cy3 的化学反应活性。柔性连接设计可确保 Cy3 与核酸链的末端或非关键区结合,而不影响 SODN19 的序列识别和折叠潜能。在纯化和保存过程中,CY3-SODN19 通常溶于去离子水或缓冲液中,避光存放,以保持荧光稳定性和核酸完整性。

总之,CY3-SODN19 通过在 SODN19 核酸链上引入 Cy3 荧光标记,实现了核酸功能与可视化追踪的结合。其反应条件温和,强调缓冲环境、温度控制以及柔性连接的设计,以确保核酸结构和杂交能力的完整性,同时获得稳定的荧光信号,为分子杂交研究、细胞示踪及核酸动力学分析提供可靠工具。

瑞禧生物供应磷脂、高分子聚乙二醇衍生物、磁性纳米颗粒、纳米金、近红外荧光染料、荧光量子点、碳纳米管、石墨烯及多种功能高分子材料。如有需求可咨询
产品名称:CY3-SODN19
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研

厂家:瑞禧生物


产品目录

CY5标记万古霉素 CY5-Vancomycin
Cy5标记维生素E,生育酚, Cy5-Tocopherol
Cy5标记香草酸 Cy5-Vanillic-Acid
CY5标记小分子药物 CY5-小分子药物

仅用于科研,不能用于人体。小编axc
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