Cy3-si435 指在特定 siRNA 序列 435 上共价标记 Cy3 花菁染料后形成的荧光标记小干扰 RNA 分子体系。该分子由三部分组成：核酸链、连接臂段以及 Cy3 荧光团。siRNA 435 是一条针对特定基因靶序列的双链 RNA，通常为 19–22 个核苷酸长度，具有可在 RNA 干扰（RNAi）机制中诱导靶 mRNA 降解的序列特异性功能。Cy3 为三甲烯型花菁染料，其结构包含两个氮杂芳香环通过多甲烯链连接形成刚性连续共轭体系，具备清晰的吸收峰（约 550 nm）和发射峰（约 570 nm），能够在可见光区域提供稳定、可观测的荧光信号。

Cy3-si435 的制备通常依赖化学修饰策略，将 Cy3 通过稳定的共价键连接到 siRNA 链的 5′ 或 3′ 端，或通过化学臂与核酸碱基修饰位点结合。标记方式包括使用 Cy3-NHS 酯与链端或修饰氨基发生亲核加成生成酰胺键，或通过叠氮-炔基点击化学形成三唑环结构。连接策略在温和条件下进行，以确保 siRNA 主链的完整性与双链结构的稳定性，同时保持其针对靶 mRNA 的识别和沉默功能。标记位置通常选择在不影响碱基配对及 RNAi 活性的链端，使荧光团在提供信号的同时不干扰功能。

Cy3-si435 在水相体系中呈均匀分散状态，带有负电荷的磷酸二酯骨架赋予其较高亲水性和良好溶解性。标记后的荧光团使 siRNA 可以在体外实验或细胞体系中直接被观察、定量及追踪，而不会影响双链 RNA 的稳定性和降解途径。Cy3 的共轭体系在水相中光学性质稳定，可用于实时监测 siRNA 的摄取、胞内运输、定位及分布。

该体系的主要特点包括：一是明确的荧光信号，使 Cy3-si435 可用于成像、流式分析及定量检测；二是序列特异性，保留 siRNA 435 对靶基因的沉默功能；三是结构稳定，化学标记后不显著影响双链构象或溶液行为；四是生物兼容性良好，可在细胞培养条件下使用而不引入明显非特异性干扰。Cy3-si435 可应用于研究 siRNA 进入细胞的路径、胞内分布以及作用效率，也可用于优化载体递送系统和评估不同化学修饰或包装策略对 RNAi 效果的影响。

总之，Cy3-si435 将荧光标记与功能性 siRNA 结合，既保留了 siRNA 435 的基因沉默能力，又提供了可视化手段，是细胞实验、递送系统评估及 RNA 动态研究中重要的荧光探针工具。

厂家：瑞禧生物

产品目录

CY7.5标记鬼笔环肽 CY7.5-Phalloidin
CY7.5标记果糖 CY7.5-D-Fructose
CY7.5标记过氧化氢酶 CY7.5-Catalase
CY7.5标记海藻酸钠 CY7.5-Alginate
CY7.5标记海藻酸钠 CY7.5-Sodium alginate