Spacer 9 Amidite 是一种常用的有机磷化试剂，广泛应用于寡核苷酸合成及功能化核酸修饰。其主要作用是作为核酸链中的柔性间隔单元，用于调节寡核苷酸的空间构型、提高链的柔性、优化分子间距离或引入功能化修饰位点。通过引入 Spacer 9 Amidite，可在寡核苷酸或其他寡聚分子中形成可控间隔，提高修饰效率、荧光标记显示和生物识别性能。

从化学结构上看，Spacer 9 Amidite 由线性或支链的碳链构成，通常含有 9 个原子长度的柔性链段。末端含有膦酰胺活性基团（如 2-cyanoethyl diisopropylphosphoramidite），可以与寡核苷酸合成中前体核苷的羟基发生磷酰化偶联，形成稳定的磷酰酰胺键。同时，其碳链灵活，可提供链段间的空间调节作用，避免核酸链过度堆积或相互干扰，从而改善目标分子的功能表现。

Spacer 9 的柔性链段还可用于连接荧光染料、药物分子或其他功能性团体，为分子示踪、药物递送和核酸功能化研究提供便利。其化学稳定性较高，对酸碱条件敏感性低，但在水相中应避免长时间暴露，以防膦酰胺官能团水解。

二、结构合成

Spacer 9 Amidite 的合成通常基于含有适当长度碳链的二醇或单醇前体，通过磷酰化策略引入膦酰胺活性官能团。典型的合成步骤包括以下几个方面：

1. 前体合成：选择含有 9 个原子长度链段的二醇或单醇作为 Spacer 核心。此链段可由直链烷基、聚乙二醇或柔性链化学修饰物组成，以保证后续合成中链段的灵活性和长度可控。

2. 功能化处理：对碳链末端羟基进行活化处理，使其具备与磷酰胺试剂反应的能力。常用方法为醇末端与二异丙基氯膦酰胺（Diisopropylchlorophosphoramidite）或 2-氰乙基二异丙基膦酰胺反应，通过碱性助剂（如 DIPEA）捕获生成的盐酸，以形成活性膦酰胺官能团。

3. 磷酰化偶联：在惰性有机溶剂体系（如二氯甲烷、甲苯或无水 DMF）中进行磷酰化反应。反应温度一般控制在 0–5°C，以提高选择性并抑制副反应。通过控制底物浓度、温度及反应时间，可获得高纯度的 Spacer 9 Amidite。

4. 纯化与表征：反应完成后，采用柱层析或高效液相色谱（HPLC）进行纯化，去除未反应前体及副产物。产物可通过核磁共振（^1H、^13C、^31P NMR）、质谱（MS）及红外光谱（IR）等方法进行结构确认，验证磷酰胺键、链段长度及官能团完整性。

5. 储存与稳定性：Spacer 9 Amidite 对水分和空气敏感，应储存在干燥、低温条件下，避免水解或氧化影响磷酰胺活性。通常在无水有机溶剂中分装保存，以保证在寡核苷酸合成中保持高反应效率。

厂家：瑞禧生物

产品目录

Cyanine 7 Tyramide Conjugates
Cy5.5 Tyramide Conjugates
AF594 Tyramide Conjugates
CAL Fluor Red 635 Amidite
CF 568 VS CF 543