Quasar 570 C6 T Amidite 是一种荧光标记核苷酸中间体，用于寡核苷酸合成中引入 Quasar 570 荧光基团。其核心结构由含有 Quasar 570 荧光染料的胸腺嘧啶核苷衍生物组成，通过 C6 连接臂与荧光染料偶联，末端含有 2-氰乙基二异丙基膦酰胺（phosphoramidite）官能团，可在固相寡核苷酸合成中与前体核苷羟基共价连接。Quasar 570 是一种高亮度、稳定的红色荧光染料，发射波长约在 570 nm 附近，适合用于分子示踪、活细胞成像及荧光定量分析。

Quasar 570 C6 T Amidite 的设计使其在寡核苷酸链中通过 C6 链段保持荧光染料的空间独立性，避免荧光淬灭或与核酸链发生相互作用。其磷酰胺官能团保证了与寡核苷酸羟基的高效偶联，同时染料分子保持光学稳定性和化学活性，适用于多轮固相合成和后续生物化学应用。

二、合成过程

Quasar 570 C6 T Amidite 的合成通常采用模块化策略，主要包括三部分：荧光染料功能化、核苷修饰以及磷酰化偶联。

1. 荧光染料功能化
   先对 Quasar 570 染料进行活性官能团引入，通常在其羧基末端通过 C6 链偶联活化剂（如 NHS 酯化反应）生成可与核苷胺或羟基发生偶联的中间体。C6 链段提供足够空间，使染料在核酸链上保持远离链干扰，减少淬灭效应。

2. 核苷修饰
   以胸腺嘧啶核苷为基础，并保留 C6 链末端与 Quasar 570 染料偶联位点。核苷修饰过程中需要控制溶剂、温度和反应时间，以保证染料与核苷的高效偶联，同时避免核苷环结构的破坏。

3. 磷酰化偶联
   偶联后，将染料修饰核苷通过磷酰化反应转化为 2-氰乙基二异丙基膦酰胺衍生物。此步骤采用二异丙基氯膦酰胺（Diisopropylchlorophosphoramidite）在碱性条件下与核苷羟基反应形成磷酰胺键。溶剂通常为干燥的二氯甲烷或 DMF，温度控制在低温，以抑制副反应和磷酰胺水解。磷酰化完成后即得到 Quasar 570 C6 T Amidite 的活性中间体，可直接用于固相合成

4. 三、纯化过程

合成完成后，Quasar 570 C6 T Amidite 需经过纯化以去除未反应染料、未偶联核苷及副产物。常用方法包括柱层析和高效液相色谱（HPLC）。

1. 柱层析
   使用硅胶柱，通过选择适当极性溶剂梯度分离产物与未反应物。染料标记核苷显示明显颜色，可作为分离参考，利于粗分离。

2. 高效液相色谱（HPLC）
   对粗产物进行精细纯化，选择反相 C18 柱，流动相为含缓冲盐的水/有机溶剂体系，通过检测 570 nm 荧光信号收集目标产物峰。此方法可获得高纯度、结构完整的 Quasar 570 C6 T Amidite，并确保磷酰胺键和染料官能团稳定。

纯化完成后，产物在干燥、避光条件下保存，以防水解和光降解。产物结构可通过核磁共振质谱（MS）及荧光光谱确认，验证磷酰胺官能团、核苷结构及染料偶联完整性。

厂家：瑞禧生物

产品目录

CF 543 Tyramide Conjugates
BTQ-2 Amidite
BTQ-1 dT Linker Amidite
BHQ-3 Succinimidyl Ester
BHQ-2 Succinimidyl Ester，916753-62-3
Perfect 100bp DNA Ladder