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NPOM-Caged-dT CE-Phosphoramidite,固相寡核苷酸合成的光控修饰核苷磷酰胺化试剂的反应步骤

时间:2025-12-17 09:35:40       浏览:97
NPOM-Caged-dT CE-Phosphoramidite,固相寡核苷酸合成的光控修饰核苷磷酰胺化试剂的反应步骤

NPOM-Caged-dT CE-Phosphoramidite 是一种用于固相寡核苷酸合成的光控修饰核苷磷酰胺化试剂。其核心是胸腺嘧啶(dT)核苷,其中 N3 位通过 NPOM(6-nitropiperonyloxymethyl)光敏保护基进行“笼式”(caged)修饰,同时 3′-羟基以 2-氰乙基(CE)磷酰胺化活化,便于在 DNA 合成仪上进行自动化链延伸。NPOM 保护基在紫外光照射下可被特异性裂解,从而释放功能性胸腺嘧啶,实现光控核酸功能调控。这种设计在光控核酸研究、光学开关探针以及时空精确调控的分子生物学实验中具有重要价值。

从化学结构上看,NPOM-Caged-dT CE-Phosphoramidite 包含三部分:

  1. 胸腺嘧啶核苷骨架,保持天然核酸结构,确保合成后寡核苷酸的杂交能力和酶识别性;

  2. NPOM 光敏保护基,通过 N3 位与胸腺嘧啶共价结合,形成笼式结构,阻止该碱基参与碱基配对或酶反应;

  3. CE 磷酰胺化活性端,通过 3′-羟基磷酰胺化提供可与前一个核苷的 5′-羟基形成磷酸酯键的功能,实现链延伸。

反应步骤通常包括三个阶段:

  1. 固相核苷链延伸
    NPOM-Caged-dT CE-Phosphoramidite 在 DNA 合成仪上与载体上的前一个核苷反应。首先去除前一个核苷 5′-DMT 保护基,暴露 5′-羟基。随后,在有机溶剂和弱碱催化剂(如 tetrazole)作用下,磷酰胺端与 5′-羟基形成不稳定的磷酸酯中间体。

  2. 氧化/稳定化步骤
    生成的磷酸酯中间体通过碘或其他氧化剂氧化为稳定的磷酸酯键,从而将 NPOM-Caged-dT 单体成功连接到寡核苷酸链上。该步骤完成后,链末端带有笼式修饰核苷,但在光照前保持碱基不活性。

  3. 光照去笼(光激活)
    在实验设计需要时,通过紫外光(通常 350–365 nm)照射,NPOM 光敏保护基裂解,将笼式胸腺嘧啶恢复为自由碱基,使其可参与碱基配对或被酶识别。该反应快速、高选择性,且不显著损伤寡核苷酸主链。

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产品名称:NPOM-Caged-dT CE-Phosphoramidite
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研

厂家:瑞禧生物


产品目录

BHQ-2-acid 荧光淬灭剂 BHQ-2-酸
BHQ-3 amine荧光淬灭剂 BHQ-3-氨基
BHQ-3 azide荧光淬灭剂 BHQ-3-叠氮
BHQ-3 DBCO荧光淬灭剂 BHQ-3-二苯基环辛炔

仅用于科研,不能用于人体。小编axc
序号 新闻标题 浏览次数 作者 发布时间
1 DOPC Liposome包载CY5脂质体包载CY菁染料定制 1186 瑞禧生物 2022-10-31
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5 瑞禧ROS响应性定制: DSPE-TK-PEO ;DBCO-SS-COOH/MAL科研 1364 瑞禧生物 2022-12-08
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7 2022瑞禧 可选分子量 PCL-TK-PEI-DOX/FA 聚已内酯响应性 1127 瑞禧生物 2022-12-08
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