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5-Hexynyl Phosphoramidite的反应原理

时间:2025-12-17 09:36:46       浏览:59
5-Hexynyl Phosphoramidite的反应原理

5-Hexynyl Phosphoramidite 是一种功能化核苷磷酰胺化试剂,主要用于固相寡核苷酸合成中在 5′末端引入末端炔基(–C≡CH)修饰。这种修饰为寡核苷酸提供了可用于点击化学(Cu(I)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition, CuAAC)或其他炔基偶联反应的活性位点,从而实现荧光标记、功能分子偶联、固相固定化及药物载体设计等应用。该试剂通过磷酰胺化活性端与前一个核苷的 5-羟基反应,完成链延伸并在末端引入可反应的炔基。

从化学结构上看,5-Hexynyl Phosphoramidite 由三部分组成:核苷骨架、磷酰胺活性端和末端炔基连接臂。核苷骨架保留了脱氧核糖和碱基结构,保证链延伸后的寡核苷酸具有正确的杂交和酶识别能力。磷酰胺活性端(通常以 2-氰乙基磷酰胺化形式存在)在合成过程中可与前一个核苷的 5-羟基形成不稳定的磷酸酯中间体。末端炔基通过六碳连接臂或短链连接臂与核苷的 5-羟基相连,使寡核苷酸在化学上具备炔基反应活性。

反应原理主要包括两步:

  1. 磷酰胺化偶联反应
    在固相合成过程中,前一个核苷 5-羟基在去除 5-DMT 保护基后暴露。5Hexynyl Phosphoramidite 的磷酰胺端在弱酸催化剂(如 tetrazole)作用下与 5-羟基发生亲核取代反应,形成临时的磷酸酯中间体。此过程中,核苷链的延伸方向和顺序得以精确控制。

  2. 氧化与稳定化
    磷酸酯中间体随后通过氧化剂(如碘水溶液)转化为稳定的磷酸酯键,从而固定 5-Hexynyl 修饰,使末端炔基保留完整。此炔基在随后的点击化学反应中作为亲核位点,可与叠氮化物分子高选择性偶联,实现荧光标记、抗体偶联或纳米载体功能化。

5-Hexynyl Phosphoramidite 的设计兼顾了化学稳定性与生物功能性。核苷骨架保持天然结构,磷酰胺化反应高效且选择性强,而末端炔基的空间隔离设计可减少 steric hindrance,保证后续偶联反应效率。其在水溶液或有机溶剂中均表现出良好的操作性,并在光照或温和化学条件下稳定。

瑞禧生物供应磷脂、高分子聚乙二醇衍生物、磁性纳米颗粒、纳米金、近红外荧光染料、荧光量子点、碳纳米管、石墨烯及多种功能高分子材料。如有需求可咨询
产品名称:5-Hexynyl Phosphoramidite
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研

厂家:瑞禧生物


产品目录

BHQ-3 Mal荧光淬灭剂 BHQ-3马来酰亚胺
BHQ-3 NHS荧光淬灭剂 BHQ-3-活性酯
BHQ-3-acid 荧光淬灭剂 BHQ-3-酸
BODlPY FL-COOH,氟化硼二吡咯羧酸,
BODlPY FL-N3,氟化硼二吡咯叠氮,

仅用于科研,不能用于人体。小编axc
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