JOE Amidite 由三个核心部分组成：核苷骨架、磷酰胺化活性端以及荧光染料 JOE。核苷骨架通常为脱氧核苷，保留天然核糖和碱基结构，保证合成后的寡核苷酸杂交性能与酶识别能力。磷酰胺化端（通常为 2-氰乙基磷酰胺化形式）在固相合成中可与前一个核苷的 5-羟基反应，实现链延伸。JOE 荧光团通过适当的连接臂与核苷碱基或核糖连接，以减少对核酸双链结构的干扰。

反应特点主要体现在以下几个方面：

1. 高选择性偶联
   JOE Amidite 的磷酰胺化活性端专一与暴露的 5羟基反应，形成临时磷酸酯中间体。该反应在弱酸催化剂（如 tetrazole）作用下高效进行，几乎不会引入非特异性副反应，保证荧光染料精确引入寡核苷酸链末端或特定位置。

2. 温和反应条件
   由于荧光团对酸碱和光敏感，JOE Amidite 的偶联在温和有机溶剂和室温条件下完成，有效保护染料的光学性能和核酸结构完整性。磷酸酯中间体通过氧化步骤（如碘氧化）转化为稳定磷酸键，确保寡核苷酸链稳定。

3. 空间隔离设计
   JOE 荧光团通过连接臂与核苷连接，提供适当的空间间隔，减少 steric hindrance 对链杂交能力的影响。同时，这种设计保持染料的光学特性，使其在合成后仍能输出明亮、稳定的荧光信号。

4. 可控标记位置
   JOE Amidite 可用于链末端标记，也可通过内部修饰实现特定位点标记，适合多通道荧光实验与定量检测。其高度可控的偶联特点，使多标记寡核苷酸的合成变得可预测和重复性高。

厂家：瑞禧生物

产品目录

BODlPY FL-NH2，氟化硼二吡咯氨基，
BODlPY FL-NHS，氟化硼二吡咯活性酯，
C5.5-氨基，Cyanine5.5-NH2，
Cy2  Cyanine2