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DABSYL Amidite,功能化核苷磷酰胺化试剂的制备方法

时间:2025-12-17 09:48:14       浏览:63
DABSYL Amidite,功能化核苷磷酰胺化试剂的制备方法

DABSYL Amidite 是一种功能化核苷磷酰胺化试剂,主要用于固相寡核苷酸合成中引入 DABSYL(4-(dimethylamino)azobenzene-4′-sulfonyl)猝灭基。DABSYL 是一种常用的非荧光猝灭染料,可通过 FRET(荧光共振能量转移)原理与荧光团配对,用于核酸探针、实时定量 PCR(qPCR)、分子开关和信号调控体系。DABSYL Amidite 的设计使其能够在寡核苷酸链的 5′ 端或内部精确引入猝灭基,从而实现可控荧光信号调节。

从结构上看,DABSYL Amidite 由三个核心部分组成:

  1. DABSYL 猝灭团:作为功能基团,通过与核苷骨架共价结合,能够高效吸收特定波长的荧光能量,实现信号猝灭。

  2. 磷酰胺化活性端(CE 型):用于固相合成中与前一核苷的 5′-羟基偶联,形成临时磷酸酯中间体,再通过氧化生成稳定磷酸酯键。

  3. 连接桥或空间隔离臂:通常采用烷基或聚醚(如 TEG)连接,使猝灭基与核酸主链保持适当距离,避免 steric hindrance 干扰核酸杂交或酶识别。

制备方法主要包括以下几个步骤:

  1. DABSYL 羟基化衍生物的制备
    首先从 DABSYL 酸或酯出发,通过醇化反应得到 DABSYL 羟基衍生物,为后续磷酰胺化提供活性位点。此过程中需控制反应温度和酸碱条件,以避免 DABSYL 分子结构受损。

  2. 磷酰胺化修饰
    将 DABSYL 羟基衍生物与 2-氰乙基氯化膦或其他磷酰胺化试剂反应,在有机溶剂和碱催化剂条件下形成 DABSYL Amidite 的磷酰胺化结构。该步骤要求反应高选择性,并尽量避免副反应或染料降解。

  3. 保护基引入与纯化
    为便于固相合成,5′-羟基通常采用 DMT(Dimethoxytrityl)或其他保护基保护。完成磷酰胺化后,通过柱层析或高效液相色谱(HPLC)对 DABSYL Amidite 进行纯化,获得高纯度、适合自动化寡核苷酸合成的功能化试剂。

瑞禧生物供应磷脂、高分子聚乙二醇衍生物、磁性纳米颗粒、纳米金、近红外荧光染料、荧光量子点、碳纳米管、石墨烯及多种功能高分子材料。如有需求可咨询
产品名称:DABSYL Amidite
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研

厂家:瑞禧生物


产品目录

CY2-sucrose CY2标记蔗糖
CY2-UrolithinA  CY2尿石素A
CY2-Zingibroside R1 CY2标记姜状三七苷R1
CY2阿糖胞苷 CY2-Cytarabine
CY2扁桃酸 CY2-Mandelic Acid

仅用于科研,不能用于人体。小编axc
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