Cyanine3 Amidite 的中文名称通常为Cyanine3 磷酰胺化物，也可称为Cyanine3 磷酰胺试剂。其中，Cyanine3 是一种常用的荧光染料，属于 Cyanine 染料家族，能够在绿色波段激发并发射橙红色荧光；“Amidite”表示其为磷酰胺化形式，可用于固相寡核苷酸合成过程中将荧光基团引入 DNA 或 RNA 链。

二、定义
Cyanine3 Amidite 是一种功能化磷酰胺化试剂，它将 Cyanine3 荧光染料与磷酰胺化核苷单元结合，使其可以通过常规的固相 DNA/RNA 合成方法被引入寡核苷酸的特定位点。该化合物在合成过程中作为活性中间体存在，经过偶联、氧化和脱保护步骤，将荧光标记共价连接在核酸链上。Cyanine3 的引入赋予寡核苷酸荧光可检测性，用于分子标记、探针设计及信号分析。

三、化学与反应特点

1. 磷酰胺化偶联：Cyanine3 Amidite 通过磷(III)中心在四唑或类似活化剂作用下活化，与固相载体上去保护的 5′-羟基或内部分子羟基发生亲核偶联反应，形成磷(III)中间体。随后通过氧化步骤生成稳定的磷酸酯键，使荧光基团牢固接入核酸链。

2. 保护与空间调节：通常通过连接臂或保护基（如 DMT）调节染料与核酸主链的距离，避免荧光团与碱基配对产生空间干扰，保证核酸链的正常构象。

3. 光学性质：Cyanine3 荧光团具有较强的吸光性和量子产率，最大吸收约在 550 nm，发射波长约在 570 nm，呈橙红色荧光。其较高的光稳定性适合于荧光检测和成像实验。

4. 溶解性与稳定性：该试剂可溶于无水有机溶剂，如乙腈或二氯甲烷，在干燥、避光条件下具有良好化学稳定性，但易受水分或强酸碱影响而发生降解，需要在合成和储存中注意保护。

四、应用特点
Cyanine3 Amidite 可用于寡核苷酸标记、荧光探针制备、FISH（荧光原位杂交）、实时 PCR 检测及生物分子追踪实验。通过固相合成引入的 Cyanine3 荧光信号稳定，标记位置可控，适合多种分子生物学研究及分析应用。

厂家：瑞禧生物

产品目录

Cyanine5-PEG-DBCO
CY5-聚乙二醇-活性酯
Cyanine5-PEG-NHS
CY5-聚乙二醇-叠氮
CY5-聚乙二醇-叠氮
CY5-聚乙二醇-氨基