CAL Fluor Orange 560 Amidite 的中文名称通常为CAL Fluor Orange 560 磷酰胺化物，亦可称为CAL Fluor Orange 560 荧光染料磷酰胺试剂。其中，“CAL Fluor Orange 560”是染料名称，表示其发射波长约为 560 nm，呈橙色荧光；“Amidite”表明其为磷酰胺化中间体，可用于固相寡核苷酸合成，将荧光基团引入 DNA 或 RNA 链中。

二、化学结构特点

1. 荧光母核结构：CAL Fluor Orange 560 属于合成荧光染料类，其核心结构通常为共轭芳香体系，能够有效吸收光能并发射橙色荧光。共轭体系保证了高吸光性和较高的量子产率，使其在检测和成像实验中表现出稳定的信号。

2. 磷酰胺化修饰：Amidite 形式的 CAL Fluor Orange 560 在分子中包含磷(III)酰胺官能团，可与固相载体上去保护的羟基发生亲核偶联反应。这种磷酰胺化结构是固相 DNA/RNA 合成的标准活性中间体形式，使染料能够通过常规自动化合成方法引入核酸链。

3. 连接臂设计：染料分子通常通过灵活的连接臂（如碳链或聚醚链）与磷酰胺基团相连。连接臂的存在可以将荧光基团从核酸主链延伸出来，减少对双链构象和碱基配对的影响，提高标记后的核酸在杂交和结合实验中的可接近性。

4. 保护与反应控制：在固相合成中，羟基通常通过 DMT 或其他保护基进行保护，以防止在不适当的步骤中发生偶联。偶联完成后，通过去保护和氧化步骤生成稳定的磷酸酯键，确保染料牢固地连接在核酸链上。

5. 溶解性与稳定性：CAL Fluor Orange 560 Amidite 可溶于无水有机溶剂，如乙腈、二氯甲烷等。干燥、避光储存可保持其化学和光学稳定性。染料母核结构及连接臂设计使其在水溶液中仍保持荧光活性，并能在分子生物学实验中长期使用。

三、总结
CAL Fluor Orange 560 Amidite 通过磷酰胺化修饰结合了高效荧光信号、可控偶联和空间延展性。其化学结构特点使其能够在寡核苷酸合成中实现精准标记，同时保持核酸链的天然构象和荧光性能，适合用于荧光探针制备、核酸检测、成像及多通道分析实验。

厂家：瑞禧生物

产品目录

CY2-聚乙二醇-生物素
Cyanine2-PEG-Biotin
CY7.5-聚乙二醇-链霉亲和素
Cyanine7.5-PEG-Streptavidin
CY7.5-聚乙二醇-酰肼
Cyanine7.5-PEG-hydrazide