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中文名称:CAL Fluor Orange 560 C6 修饰脱氧胸苷磷酰胺
(亦称:CAL Fluor Orange 560 C6 dT Amidite、橙色荧光标记脱氧胸苷磷酰胺单体)
反应机制(约600字):
CAL Fluor Orange 560 C6 dT 亚磷酰胺是一种用于固相核酸合成的荧光标记磷酰胺单体,其结构由脱氧胸苷(dT)骨架、六碳柔性连接臂(C6)和荧光染料 CAL Fluor Orange 560 组成,并在 3′ 位带有可参与磷酰胺化反应的三价磷原子活性中心。该设计使分子在自动 DNA 合成过程中可稳定引入红橙色荧光标记。
其化学反应机制主要包括以下几个环节:
磷酰胺化反应活化:
CAL Fluor Orange 560 C6 dT 亚磷酰胺在无水有机溶剂(如乙腈)中溶解后,利用活化剂(如四苯基膦或二异丙基氨基氯化亚磷衍生物)将磷酰胺活性增强。活化后的磷原子呈现亲电性,可与固相载体上的羟基发生亲核取代反应。偶联反应:
在固相合成过程中,固相载体上的 5′-羟基或其他核酸链羟基对活化的磷原子进行亲核攻击,形成磷酸二酯键,从而将 CAL Fluor Orange 560 荧光标记通过 C6 柔性连接臂稳定地引入核酸链中。C6 连接臂提供空间缓冲,降低荧光染料与核酸骨架之间的相互作用,使荧光性能保持稳定。氧化稳定化:
形成的磷酸三酯中间体通过氧化处理(如碘溶液氧化)转化为稳定的磷酸二酯结构。该步骤保证荧光标记在后续洗脱和分析过程中不发生降解,同时使荧光标记与核酸链牢固结合。脱保护与清洗:
在磷酰胺化完成后,保护基(如 DMT)在温和酸性条件下去除,暴露出标记后的核酸链末端羟基,以便进行下一轮延伸或进一步修饰。整个过程中,通过洗脱和干燥步骤去除多余试剂和副产物,确保标记效率和分子纯度。

纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研
厂家:瑞禧生物
产品目录
Cy5-Etoposide
CY5标记的依维莫司
Cy5-Everolimus
CY5标记的乙酰甲胺酚
Cy5-Acemetacin
CY5标记的乙酰克林
Cy5-Ethacridine
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| 1 | DOPC Liposome包载CY5脂质体包载CY菁染料定制 | 1189 | 瑞禧生物 | 2022-10-31 |
| 2 | 水溶性PEG连接剂Azido-PEG6-acid;N3-PEG6-COOH用于生物偶联 | 1050 | 瑞禧生物 | 2023-01-03 |
| 3 | 可降解6 个单元 PEG 的 ADC linker之Azido-PEG6-NHS ester瑞禧生物 | 1106 | 瑞禧生物 | 2023-01-03 |
| 4 | 瑞禧生物Azido-PEG7-amine;N3-PEG7-NH2叠氮PEG7氨基 | 1012 | 瑞禧生物 | 2023-01-03 |
| 5 | 瑞禧ROS响应性定制: DSPE-TK-PEO ;DBCO-SS-COOH/MAL科研 | 1369 | 瑞禧生物 | 2022-12-08 |
| 6 | 2022瑞禧 生物素化响应性Biotin-PEG-SS-DBCO/Biotin-SS-Sulfo-NHS | 1038 | 瑞禧生物 | 2022-12-08 |
| 7 | 2022瑞禧 可选分子量 PCL-TK-PEI-DOX/FA 聚已内酯响应性 | 1130 | 瑞禧生物 | 2022-12-08 |

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