Cy3.5 dimethyl（中文名称：氰3.5二甲基，CAS: 42849-61-6）是一类中波长发射菁染料，也称Cy3.5 Dimethyl Cyanine、Dimethyl Trimethine Cyanine。其核心为trimethine cyanine结构，共轭链长度短于Cy5与Cy7系列，因此吸收和发射位于可见光至近红外过渡区域。

由于共轭链较短，Cy3.5 dimethyl通常具有较高的荧光稳定性和较小的光漂白速率。相比长链菁染料，其对光氧化的敏感性略低，因此在长时间激发条件下更易维持稳定输出。

分子中的二甲基取代会影响杂环电子云密度，使吸收峰更加集中，并减少部分非辐射跃迁路径。正因如此，该染料在中等极性溶剂中常表现出较高的荧光效率。

从应用角度看，Cy3.5 dimethyl常作为能量转移体系中的供体染料。其发射波长与Cy5类染料吸收区域存在良好重叠，因此适用于构建FRET体系，用于研究分子距离变化和组装行为。

在材料嵌入中，该染料可稳定存在于聚合物纤维、树脂膜及脂质结构中。由于体积较小，其扩散速度通常高于Cy7系列，因此在薄膜均匀分布方面更具优势。

此外，Cy3.5 dimethyl对微环境黏度变化敏感。当周围体系黏度升高时，其分子内旋转受限，荧光强度往往上升，因此也可作为微黏度响应探针。

在有机合成中，其常通过季铵盐缩合构建主链，再通过甲基化控制端基电子性质。不同端基修饰可进一步改变光谱窗口。

总体而言，Cy3.5 dimethyl是一类兼具较高稳定性、适中波长和良好结构可调性的经典菁染料，在功能材料和分子光学设计中具有持续应用价值。

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