CY5‑COOH，中文名称花氰染料 CY5‑羧基，CAS 号 1032678‑07‑1，属于经典的五甲川花菁类荧光染料，分子末端携带游离羧基官能团，是众多 CY5 系列衍生标记物的基础母体原料。该染料分子拥有长共轭甲川发色骨架，共轭链长度直接决定其光谱特征，*大激发波长处在 646nm，*大发射波长为 662nm，落在近红外荧光窗口区间，该波段受基质背景荧光干扰程度低，在光学示踪、材料标记、分子探针构建领域具备突出应用价值。

分子结构上，两个吲哚啉杂环通过五条甲川碳链相连，一侧吲哚环上连接带有羧基的烷基侧链，羧基基团可通过碳二亚胺类缩合反应，与伯氨基发生酰胺键偶联，实现对氨基修饰分子、高分子骨架、纳米颗粒表面的荧光共价修饰。相比于氨基活化后的 CY5 衍生物，CY5‑COOH 本身水溶性处于中等水平，可在二甲基甲酰胺、二甲基亚砜等极性非质子溶剂中充分溶解，在纯水体系中溶解度有限，进行标记反应时通常需要搭配有机共溶剂提升染料分散效果。

该染料光稳定性优于很多短波长荧光基团，但长时间强光照射依旧会发生光漂白现象，实验操作过程应当尽量避光保存与反应。作为基础标记砌块，它不直接作为成品探针使用，更多用于中间体合成，可对多糖、多肽、小分子活性物质、聚合物载体进行荧光功能化改造。通过缩合反应将 CY5 荧光骨架共价接入目标底物，就可以赋予底物近红外荧光信号，方便后续借助荧光光谱仪、荧光成像设备完成分子行为观测。

在材料化学方向，CY5‑COOH 常用来标记各类多孔高分子、水凝胶基质，表征材料在液相环境中的扩散行为；在分子组装研究中，用于追踪两亲分子组装体的分散状态；也可用于合成荧光标准品，用来校准荧光检测设备的光谱响应参数。储存条件需要避光低温密封，避免羧基发生水解变质，开封后尽快完成合成使用，减少染料氧化降解。

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