AF647‑COOH（AF647‑羧酸），英文别名Alexa Fluor 647 Carboxylic Acid、AF‑647‑Carboxylate、Alexa Fluor647‑CO₂H，属于Alexa Fluor系列远红光波段荧光染料，分子带有游离羧酸官能团，无需预连接活化基团，是制备各类荧光标记中间体的基础染料原料。该染料激发波长647 nm，发射波长665 nm，处于远红光区间，该波段受基质自发荧光干扰程度低，光稳定性强，荧光量子产率高，适合高信噪比的显微成像与光谱表征工作。

AF647‑COOH（AF647‑羧酸）本身不具备直接偶联活性，羧酸基团需要借助碳二亚胺类缩合试剂活化，转化为活性酯中间体，才能够和伯氨基发生酰胺化反应，实现染料与底物的共价偶联。相比于已经活化完成的NHS酯染料，羧酸型染料具备更高的合成自由度，科研人员可根据合成体系自行选择活化条件、活化试剂，适配不同溶剂环境，灵活定制各类荧光偶联产物，适合实验室自主合成荧光探针。

该染料水溶性优异，分子结构中自带多个磺酸基团，*大提升水相溶解能力，在纯水缓冲体系中可以充分溶解，不易发生染料聚集淬灭。远红光谱特性可以和蓝、绿、橙红波段荧光试剂搭配搭建多色标记体系，实现多组分并行示踪。未活化状态下染料化学性质稳定，避光低温储存条件下荧光基团不易降解，可长期保存，不存在NHS酯类染料易水解失效的短板。

在合成应用层面，AF647‑COOH（AF647‑羧酸）用于合成荧光修饰小分子、荧光多肽、荧光高分子。可活化后接枝到氨基化纳米颗粒、氨基改性固相材料表面，制备远红光荧光功能基底。在光谱测试实验中，也可作为荧光参比物质，用于校正仪器光谱响应。缩合活化环节需要严格控制水分含量，水相体系会造成活化中间体快速水解，有机相环境更利于缩合反应进行。染料原液需要避光存放，光照会造成荧光骨架破坏，降低荧光强度。

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