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化学结构与基本性质
5-vinyl-uridine 是一种 RNA 核苷类似物,其核心结构基于天然核苷 尿苷(uridine),在嘧啶环的 5 位引入了乙烯基(vinyl)取代基。这一改造在保持核苷骨架完整性的同时,为核酸分子提供了化学反应活性位点。其分子式为 C11H14N2O5,具有一定的疏水性和化学稳定性,在水溶液和常规有机溶剂中均可溶解,便于实验操作和储存。
5-vinyl-uridine 的乙烯基基团可以参与多种后续化学反应,例如光交联、点击化学以及其他共价修饰,使其成为核酸化学研究中灵活的工具。
合成与修饰特点
5-vinyl-uridine 可通过对尿苷分子 5 位的选择性乙烯基化制备。乙烯基的引入为 RNA 提供了可控化学活性,而不显著影响 RNA 链的合成和稳定性。其主要特点包括:
点击化学修饰:乙烯基可与含硫、含硝基或含炔基的化合物进行共价连接,用于荧光或生物素标记。
光敏交联:乙烯基能够参与光引发的交联反应,用于固定 RNA 与蛋白或其他分子的相互作用。
聚合及功能化:可在特定体系中参与聚合或后续功能化反应,生成具有特定性质的 RNA 衍生物。
这种修饰使 5-vinyl-uridine 在 RNA 研究和分子标记中具有显著应用价值。
在 RNA 研究中的应用
5-vinyl-uridine 可被 RNA 聚合酶识别并整合到新合成的 RNA 链中,从而实现以下应用:
新合成 RNA 标记:通过乙烯基与荧光染料或生物素的化学连接,追踪细胞内 RNA 的合成、定位及动态变化。
RNA-蛋白互作研究:乙烯基可用于光交联 RNA 与结合蛋白,帮助解析 RNA 的结合网络和功能机制。
结构和功能分析:在 RNA 分子中引入 5-vinyl-uridine 可用于研究 RNA 的空间构象及分子间相互作用,同时保持 RNA 生物活性。
5-vinyl-uridine 提供了非放射性的标记手段,使实验操作更安全,同时具有高度选择性和可控性。
实验操作与注意事项
在实验使用中,5-vinyl-uridine 需要注意以下要点:
溶解与储存:可溶于水或缓冲液,低温避光保存可维持化学稳定性。
反应条件:乙烯基易受强氧化剂或强酸影响,应避免高温或极端 pH 条件。
酶兼容性:大部分 RNA 聚合酶可将其作为底物整合,但反应效率可能略低于天然尿苷,建议先行小规模验证。
总结
5-vinyl-uridine 是一种在尿苷 5 位引入乙烯基的 RNA 核苷类似物。其化学活性和生物相容性使其在 RNA 标记、光交联、分子互作研究以及 RNA 功能分析中具有广泛用途。通过与点击化学和光敏交联结合,研究人员能够实现对 RNA 的高选择性标记和功能研究,为核酸化学及分子生物学实验提供了便利工具。
常用名 5-vinyl-uridine
英文名 5-vinyl-uridineCAS号 55520-64-4
分子量 270.23900
密度 N/A
沸点 N/A

熔点 N/A
MSDS N/A
闪点 N/A
产地信息:陕西 · 西安
包装规格:产品提供瓶装形式,常规包装规格包括100 mg、250 mg 和 500 mg,亦可根据需求定制。
产品形态:可根据实验需要提供为固体、粉末或溶液状态,便于不同应用场景。
储存建议:为保持产品的活性与稳定性,建议低温冷藏保存。
厂家信息
西安瑞禧生物科技有限公司是一家集研发、生产和销售为一体的科研试剂企业,专注于功能分子与高分子材料的开发与定制服务。公司拥有成熟的合成技术体系和丰富的实验经验,产品类型覆盖多个研究方向,广泛服务于高校、科研院所及企业实验室。
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