CY3-SODN19 指在寡核苷酸 SODN19 上共价引入 Cy3 花菁染料后形成的荧光标记核酸体系。该分子体系主要由三部分组成：SODN19 寡核苷酸链、连接臂段以及 Cy3 荧光团。SODN19 是一条 19 个碱基长度的单链寡核苷酸，具有序列特异性，可在体外实验中用于基因调控、配对识别或探针分析。Cy3 属于三甲烯型花菁染料，由两个氮杂芳香环通过多甲烯链连接形成连续 π 共轭体系，具有约 550 nm 的吸收峰和约 570 nm 的发射峰，可为寡核苷酸提供可视化荧光信号，用于监测其行为和分布。

CY3-SODN19 的标记通常依赖于化学反应，将活化的 Cy3 分子与 SODN19 上预先设计的反应位点共价结合。常用的标记方式包括 Cy3-NHS 酯与寡核苷酸末端或修饰氨基的亲核加成反应，以及通过点击化学 [3+2] 环加成实现稳定三唑环连接。反应条件是影响标记效率和寡核苷酸稳定性的重要因素，需在温和可控的条件下进行，以保证荧光信号稳定且不破坏 SODN19 链结构。

一般反应条件如下：首先，SODN19 需要在适度缓冲液中溶解，通常使用弱碱性条件（pH 7.5–8.5），以使末端氨基保持适度去质子化状态，提高亲核活性。过高或过低 pH 会导致 RNA/DNA 链的水解或降解。反应温度通常控制在室温或略低，以避免热诱导的寡核苷酸变性或构象变化。反应时间一般在数小时范围内，根据染料浓度和反应位点数量进行优化，确保充分反应但避免副反应产生。

在溶液中，Cy3-NHS 酯通常溶解于少量无水有机溶剂（如 DMSO），然后缓慢加入 SODN19 溶液，保证溶液均匀混合，减少局部高浓度导致的副反应。若采用点击化学标记，则需在 RNA/DNA 链上预修饰叠氮或炔基，并在铜催化剂存在下进行环加成反应，该方法温和、选择性高，反应速度快，生成的三唑环具有良好的稳定性和耐水性。

反应完成后，需要通过透析、凝胶过滤或反相高效液相色谱（HPLC）去除未反应的自由染料及副产物，以获得纯净的 CY3-SODN19。纯化后的标记寡核苷酸在水相中分散良好，带负电荷，荧光性质稳定，可在体外实验或细胞体系中实现可视化追踪。

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产品目录

CY7.5标记卵清蛋白 cy7.5-Ovalbumin
CY7.5标记氯霉素 CY7.5-Chloramphenicol
CY7.5标记氯叶绿素e Cy7.5-Ce6
CY7.5标记莫能菌素 CY7.5-Monensin
CY7.5标记牛血清白蛋白 CY7.5-BSA