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CY3-survivin-siRNA,CY3标记的survivinsiRNA的反应机理

时间:2025-12-09 09:53:24       浏览:54
CY3-survivin-siRNA,CY3标记的survivinsiRNA的反应机理

CY3-survivin-siRNA 指将 Cy3 荧光染料标记在针对 Survivin 基因的 siRNA 分子上形成的荧光标记核酸体系。该体系由三部分组成:功能性 siRNA 链、Cy3 荧光团以及连接臂段。Survivin-siRNA 是一条针对 Survivin mRNA 的双链小干扰 RNA,通常长度为 19–22 个核苷酸,可在 RNA 干扰(RNAi)机制中引导靶 mRNA 降解,实现序列特异性沉默。Cy3 为三甲烯型花菁染料,其结构包含两个氮杂芳香环通过多甲烯链形成刚性 π 共轭体系,具有约 550 nm 的吸收峰和约 570 nm 的发射峰,可为 siRNA 提供稳定的荧光信号,用于可视化追踪。

CY3-survivin-siRNA 的标记依赖于化学反应机理,通过在 siRNA 链末端或修饰位点引入可反应官能团,使 Cy3 与 siRNA 形成共价连接。常用反应包括活化酯反应和点击化学。对于 Cy3-NHS 酯标记,其机理为亲核加成反应:siRNA 链上氨基作为亲核试剂,对 NHS 酯上的碳酰中心进行攻击,形成四面体型过渡态,随后 NHS 基团离去,生成稳定的酰胺键,将 Cy3 固定在 RNA 链上。该反应温和、选择性高,不破坏 RNA 双链结构,也不会影响 siRNA 的沉默功能。

另一种常用机理是点击化学反应。若 siRNA 链在末端或特定碱基上预修饰炔基或叠氮基,Cy3-叠氮或 Cy3-炔基在铜催化条件下发生 [3+2] 环加成,形成稳定的三唑环连接。该反应具有高选择性、温和条件和快速反应速度,能够在水性体系中实现高效标记,同时保持 siRNA 的结构稳定性和功能完整。点击化学标记后形成的三唑环具有较高的水溶性和化学稳定性,适合后续生物实验和追踪应用。

反应过程中,标记位点的选择非常关键。通常选择在不干扰碱基配对和 RNAi 活性的链端,保证 siRNA 在 RISC 装配及靶 mRNA 识别过程中的功能完整。Cy3 的引入通过柔性连接臂固定在链端或侧链位置,使荧光团可在水相中保持自由度,同时避免对 RNA 双链结构或负电荷骨架产生干扰。

反应完成后,通过透析、凝胶过滤或高效液相色谱(HPLC)去除未反应的游离染料,得到纯净的 CY3-survivin-siRNA。标记后的分子在水相中呈均匀分散状态,保持负电荷和良好溶解性,荧光信号稳定,可在体外实验或细胞体系中用于实时追踪、定位和定量分析。

瑞禧生物供应磷脂、高分子聚乙二醇衍生物、磁性纳米颗粒、纳米金、近红外荧光染料、荧光量子点、碳纳米管、石墨烯及多种功能高分子材料。如有需求可咨询
产品名称:CY3-survivin-siRNA
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研

厂家:瑞禧生物


产品目录

CY7.5标记葡聚糖 CY7.5-Dextran
CY7.5标记葡萄糖氧化酶 CY7.5-Glucose oxidase
CY7.5标记琼脂 CY7.5-Agarose
CY7.5标记人血清白蛋白 CY7.5-HSA

仅用于科研,不能用于人体。小编axc
序号 新闻标题 浏览次数 作者 发布时间
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