Cyanine3 amine（CY3-NH2，Cy3-氨基，脂溶性CY3胺，CAS: 2247688-56-6）是一种发橘黄色荧光的花菁素类染料，其分子中含有伯胺基团，可与NHS酯、碳二亚胺活化的羧基及环氧化物等活性基团发生共价偶联。该化合物外观为红色粉末，分子量627.73，激发波长555 nm，消光系数高达150000 L·mol⁻¹·cm⁻¹，在水中溶解度中等，但在DMF、DMSO、甲醇等极性有机溶剂中溶解性优良。

CY3-NH2经典且不可替代的应用场景是核酸分子的荧光标记。由于其伯胺基团可与核酸合成中引入的氨基修饰碱基（如氨基己基修饰的dT或dU）通过稳定的酰胺键连接，研究者能够在PCR扩增、DNA测序、荧光原位杂交（FISH）等实验中获得高信噪比的荧光信号。Cy3的荧光亮度高、背景低，且对pH不敏感，在530至561 nm激光激发下配合TRITC滤片即可成像，适配绝大多数荧光显微镜平台。

从荧光显微镜技术的角度看，CY3-NH2是多色标记实验中的"黄金搭档"。其发射光谱与DAPI（蓝色）、FITC/Alexa488（绿色）以及Cy5/Alexa647（远红色）之间具有良好的光谱分离度，可轻松实现四色甚至五色同时成像。在单分子荧光追踪实验中，Cy3的高光稳定性使其成为全内反射荧光显微镜（TIRF）和超分辨率显微镜（如STORM、PALM）的常用探针。

此外，CY3-NH2也被广泛用于蛋白质与多肽的荧光标记。其伯胺可与蛋白质表面赖氨酸残基的ε-氨基或N端α-氨基反应，也可通过NHS酯交联策略实现定向标记。不过需注意，由于该染料为脂溶性，在纯水相标记反应中需加入DMF或DMSO作为共溶剂以确保充分溶解。储存条件为-20℃避光干燥保存，有效期可达24个月，运输时室温条件下可稳定3周，但须严格避光防潮。

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