西安瑞禧最近开拓了新的科研方向——酶抑制剂靶点预测，其中包括药物发现、药物靶点预测、药物靶标发现、先导化合物筛选、药物设计服务、靶标预测服务、药物虚拟筛选、药物/小分子定制合成、化合物结构优化活性/药物筛选、虚拟新药筛选服务。本文小编主要介绍的是：分子对接筛选定制。

以SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白和2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2) Mpro水解酶为靶标,从TCMSP数据库中筛选SARS-CoV-2-ACE2结合阻断剂和SARS-CoV-2 Mpro水解酶抑制剂,指导以中药小分子为前体的抗SARS-CoV-2新药的研发.方法:根据文献报道,确定SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白和SARS-CoV-2 Mpro水解酶晶体结构模型上的活性位点,利用LibDock分子对接技术虚拟筛选TCMSP数据库中的小分子化合物,结合打分值以及化合物与靶蛋白受体的相互作用模式优化筛选结果,获得具有抗SARS-CoV-2潜在活性的中药小分子化合物.

结果:确定SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白结构中位于结合表面上的ASP38,GLN42,GLN325,GLU329,TYR436和TYR491以及SARS-CoV-2 Mpro水解酶结构中的THR24,THR25,THR26,LEU27,ASN28和ASN119为本次分子对接的关键氨基酸;分子对接筛选得到20个能与关键氨基酸形成氢键的候选SARS-CoV-2-ACE2结合阻断剂,其中主要来源于栀子,甘草,山豆根和洋金花的4个成分与靶蛋白的对接效果较好;筛选得到34个能与关键氨基酸形成氢键的候选SARS-CoV-2 Mpro水解酶抑制剂,其中主要来源于干姜,黄药子,升麻,荠菜的4个成分与靶蛋白的对接效果较好;甘草成分甘草酚E和黄药子成分延龄草苷元分别与靶蛋白作用的关键氨基酸数量最多或形成的氢键数量最多,分子对接效果良好.

结论:来源于中药的4个SARS-CoV-2-ACE2结合阻断剂和4个SARS-CoV-2 Mpro水解酶抑制剂具有潜在的抗SARS-CoV-2活性,其中甘草成分甘草酚E和黄药子成分延龄草苷元可优先选择进行后续抗SARS-CoV-2新药的研发.

瑞禧酶抑制剂靶点预测相关方向：

药物靶点评估

化合物库定制

AI虚拟筛选药物服务

分子对接筛选定制

药效团筛选定制

靶中化合物设计

靶点及信号通路验证