磷脂酰胆碱由一个胆碱的“头部”和甘油酸磷脂组成，甘油酸磷脂的尾部可以是各种各样的脂肪酸。通常，一条尾部是饱和的脂肪酸（可以是棕榈酸，也叫十六烷酸；或者十七烷酸，最早由Gobley在蛋黄中发现），另外一条是不饱和脂肪酸（例如油酸，最早由Gobley发现）。但是也有一些是两条都是饱和脂肪酸的。例如，动物肺部的磷脂酰胆碱，有较高部分比例的二棕榈酰磷脂酰胆碱。

高效液相色谱法(HPLC)和其它色谱法是获得高纯度单组分的有效方法，但无论薄层色谱或是高效液相色谱，处理量都很小，不适合制备大量高纯度的磷脂酰胆碱。快速柱层析法是色谱法的一种，操作简便，迅速，分离效果好，无论是少量制备或是批量生产柱色谱是分离纯化磷脂酰胆碱的一种有效的方法。

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