RGD‑Cyanine5.5 Cy5.5‑RGD 菁染料Cy5.5修饰RGD多肽，补充别名Cyanine5.5‑cRGD、Cy5.5‑Arg‑Gly‑Asp、Cy5.5‑cyclo‑RGD，是以花菁近红外染料Cy5.5共价标记RGD多肽得到近红外荧光多肽探针，可选用线性或者环化RGD序列完成偶联，环化版本探针分子识别性能更加优异。Cy5.5属于长波长近红外花菁染料，激发与发射光谱落在近红外区间，相比FITC、罗丹明类可见光染料，能够规避体系当中生物组分自发荧光干扰，降低背景噪声，检测信噪比更高；多肽部分保留RGD特征识别序列，可以特异性和对应受体蛋白发生相互作用，染料与多肽之间可增设短连接单元，减少发色基团对多肽构象的干扰。

合成方式可通过多肽侧链赖氨酸氨基，与Cy5.5‑NHS活性酯发生缩合反应完成标记，反应结束后利用反相高效液相色谱分离游离染料，去除未标记多肽组分，得到纯化探针。该探针可溶于水相缓冲液、甲醇‑水混合溶剂，分子带有磺酸基团，水溶性表现良好；长波长花菁染料对光照较为敏感，长时间光照容易发生光降解，粉末避光‑20℃保存，工作液建议现配现用，避免反复冻融。

该探针面向体外光谱学与分子互作研究，依托近红外荧光信号优势开展检测工作。可采用荧光分光光谱、荧光偏振技术，定量探究RGD多肽和靶标蛋白之间结合动力学，测定二者结合常数、解离常数；也可用于固相载体、微颗粒结合实验，借助近红外荧光成像设备，观测多肽探针在固相界面的吸附分布状态，对比线性RGD与环化RGD探针在同等条件下结合能力差异。在多组分混合体系当中，Cy5.5的近红外信号可以和可见光荧光探针实现多通道并行检测，完成多重分子同时示踪，解析多配体共存条件下分子之间的竞争结合效应。

体系当中高浓度有机溶剂、强氧化物质会造成Cy5.5荧光淬灭；探针浓度不宜过高，高浓度条件花菁染料容易发生分子聚集，引发自淬灭，造成检测数据偏差。设置游离染料对照组，扣除未偶联染料带来的背景信号，保障实验数据可靠性。该探针仅用于体外光谱检测、多肽‑蛋白互作基础科研。

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